Dell Technologies và Viện nghiên cứu bộ gen chuyển đổi (TGen) có một lịch sử hợp tác lâu dài để cho phép nghiên cứu đột phá với kết quả thay đổi cuộc sống. Tọa lạc tại Phoenix Arizona, TGen là một viện nghiên cứu y tế phi lợi nhuận liên kết với City of Hope, một trung tâm nghiên cứu và điều trị độc lập nổi tiếng thế giới về các bệnh đe dọa đến tính mạng.

TGen tận dụng nhiều siêu máy tính của Dell Technologies để làm sáng tỏ bí mật về bộ gen người và phát triển các loại thuốc chính xác cho các bệnh như COVID và các bệnh truyền nhiễm khác, ung thư, rối loạn thần kinh và các rối loạn hiếm gặp ở trẻ em. TGen sử dụng sức mạnh siêu máy tính của mình để xác định các lựa chọn điều trị cá nhân và chính xác hơn, sớm hơn, để cứu nhiều mạng sống hơn.

Ví dụ: TGen đã chạy một cụm HPC được sử dụng chủ yếu cho bộ gen của mầm bệnh và đang trong quá trình xây dựng một hệ thống mới hơn dựa trên Máy chủ Dell EMC PowerEdge R640 với bộ xử lý Intel® Xeon® Scalable, bộ lưu trữ Dell EMC Isilon và mạng Dell EMC PowerSwitch.

TGen và City of Hope cũng có hệ thống lấy GPU làm trung tâm dựa trên Máy chủ Dell EMC PowerEdge C4140 và R640 với GPU NVIDIA® V100, kết nối mạng Dell EMC PowerSwitch và bộ nhớ gắn mạng Dell EMC Isilon mà họ sử dụng chủ yếu cho các mô phỏng động lực học phân tử.

Giờ đây, một hệ thống HPC được nâng cấp, ban đầu được xây dựng bởi TGen, Dell Technologies và Intel vào năm 2012, đang cho phép TGen xử lý lượng dữ liệu khổng lồ liên quan đến giải trình tự bộ gen. Việc xây dựng hệ thống không phải là một kỳ công kỹ thuật nhỏ, vì tính năng giải trình tự thế hệ tiếp theo (NGS) thường thu thập một terabyte dữ liệu trở lên mỗi khi trình sắp xếp trình tự chạy và TGen chạy nhiều trình tự sắp xếp suốt ngày đêm. TGen cần một hệ thống HPC có khả năng lưu trữ, xử lý và tính toán đối với các tập dữ liệu khổng lồ đó—với mục tiêu giảm đáng kể thời gian cho kết quả.

Siêu máy tính được nâng cấp mang đến cho TGen sức mạnh xử lý của 3.000 lõi xử lý Intel® Xeon®, mang đến cho các nhà nghiên cứu 1 triệu giờ CPU mỗi tháng để thực hiện 50 nghìn tỷ phép tính mỗi giây. Hệ thống giải trình tự bộ gen cũng cung cấp hơn 3 petabyte dung lượng lưu trữ gắn mạng mở rộng Dell EMC Isilon.

Việc nâng cấp cắt giảm thời gian xử lý dữ liệu từ hai tuần xuống chỉ còn tám giờ. Sự cải thiện đáng kể về hiệu suất này cho phép TGen cung cấp các phương pháp điều trị được cá nhân hóa để cứu mạng sống sớm hơn. Nó cũng giúp TGen làm sáng tỏ bí mật của các bệnh truyền nhiễm, cũng là những sinh vật dựa trên DNA. Điều đó giúp viện đóng vai trò tích cực trong cuộc chiến chống lại COVID-19 . TGen đã phát triển một xét nghiệm RNA cho COVID-19 và đã tiến hành xét nghiệm cho các bệnh nhân địa phương kể từ tháng 3 năm 2020. Các nhà nghiên cứu đang giải trình tự tất cả các kết quả xét nghiệm dương tính và xây dựng một ngân hàng sinh học các dấu hiệu di truyền cho căn bệnh này theo thời gian.

Sau đó, các nhà nghiên cứu tại TGen có thể sử dụng những hiểu biết thu được từ việc giải mã trình tự virus để tìm kiếm các loại thuốc có hiệu quả chống lại nó. Là một phần của dự án này, TGen có thể phân tích dữ liệu trên siêu máy tính Zenith của Dell Technologies HPC & AI Innovation Lab. Với tư cách là một chi nhánh của City of Hope, TGen đang đóng góp vào quá trình phát triển tiền lâm sàng của vắc-xin ngừa vi-rút corona mới.

Theo TGen CIO James Lowey, “Trong nhiều năm, tôi đã có cơ hội làm việc với nhiều người tại Dell, những người thực sự đam mê những gì họ làm và tin tưởng vào sứ mệnh. Tôi nghĩ Michael Dell đã nói đúng nhất khi ông ấy nói rằng không chỉ xây dựng công nghệ vì lợi ích của công nghệ. Đó là về việc xây dựng công nghệ để giải quyết vấn đề, hoạt động trong công việc thực tế và tạo ra sự khác biệt. Triết lý đó rất phù hợp với những gì chúng tôi đang cố gắng thực hiện tại TGen. Có một đối tác thực sự đầu tư vào việc cố gắng thay đổi mọi thứ tốt hơn là vô cùng quan trọng. Đó là điều mà chúng tôi đánh giá rất cao.”

Một nghiên cứu điển hình mới phác thảo mối quan hệ lâu dài giữa TGen và Dell Technologies, cũng như các chi tiết kỹ thuật và kết quả đáng kinh ngạc của việc nâng cấp hệ thống NGS gần đây và tác động của nó đối với nghiên cứu COVID-19.

Công ty cổ phần thương mại Máy Chủ Hà Nội   

- Trụ sở Hà Nội: Tầng 1,2,4 - Tòa nhà PmaxLand số 32 ngõ 133 Thái Hà - Q. Đống Đa   

Hotline mua hàng Hà Nội: 0979 83 84 84       Điện thoai: 024 6296 6644   

- CN Hồ Chí Minh: Lầu 1- Tòa nhà 666/46/29 Đường 3/2- Phường 14 - Quận 10   

Hotline mua hàng Hồ Chí Minh: 0945 92 96 96      Điện thoai: 028 2244 9399   

- Email: hotro@maychuhanoi.vn   

- website: https://maychuhanoi.vn/   

- facebook: https://www.facebook.com/maychuhanoi